Mapa Jižního Súdánu
Jižní Súdán se nachází v severovýchodní Africe, kde hraničí se Súdánem, Etiopií, Kením, Ugandou, Demokratickou republikou Kongo a Středoafrikou. Krajina je charakterizována převážně nízkou nadmořskou výškou s rozlehlými pahorkatinami, savanami a lesy, zatímco východ a jihovýchod jsou značeny horskými pásy. Nejmerkantilnější geografickou vlastností je řeka Bílý Nil, která protéká územím a tvoří jednu z nejdůležitějších vodních cest v Africe.